XDrawChem es una aplicación para dibujar y analizar estructuras químicas y reacciones.
XDrawChem es un programa de dibujo de moléculas bidimensionales para sistemas operativos Unix. Es similar en funcionalidad a otros programas de dibujo de moléculas como ChemDraw (TM, CambridgeSoft). Puede leer y escribir MDL Molfiles, y leer texto y archivos binarios de ChemDraw, para permitir el intercambio entre XDrawChem y otras aplicaciones de química, y puede crear imágenes en formatos populares como PNG y EPS. XDrawChem ha sido probado en Linux, SGI IRIX 6.5, Sun Solaris, Mac OS X y Windows.
Las características de XDrawChem incluyen:
- Longitud fija, ángulo fijo de dibujo.
- Alineación automática de figuras. Detecta estructuras, texto y flechas y las coloca automáticamente.
- Puede dibujar anillos y otras estructuras automáticamente: tiene todos los aminoácidos estándar y ácidos nucleicos en la biblioteca incorporada.
- Puede recuperar estructuras de una base de datos de red basada en el número CAS, fórmula o nombre. También puede recuperar información sobre una molécula en un dibujo. El archivo de datos (05 de agosto de 2005, separado por comas, ~ 60 MB) está disponible gratuitamente. Esta base de datos se obtuvo de los datos de PubChem a partir de julio de 2005.
- Puede dibujar símbolos como carga parcial, radicales, etc.
- Puede leer MDL Molfiles, CML [Lenguaje de marcado químico, definido en J. Chem. Inf. Comput Sci.39 (1999), 928-942], formato binario ChemDraw (TM), formato de texto XML ChemDraw (TM).
- Puede escribir en formato de texto XML MDL Molfiles, CML, ChemDraw (TM).
- También puede leer y escribir cualquier formato compatible con la versión actual de OpenBabel.
- Puede exportar imágenes en PNG, mapa de bits de Windows (* .bmp), PostScript encapsulado (EPS) y gráficos vectoriales escalables (SVG).
- Puede generar estructuras tridimensionales con la ayuda del programa externo BUILD3D.
- Ayuda en línea, incluida información sobre herramientas.
- Predicción de 13C-NMR, basada en Bremser W, Mag. Res. Chem.23 (4): 271-275
- Predicción de 1H-NMR, basada en reglas aditivas y métodos de búsqueda de grupos funcionales, descritos en Pretsch, Clerc, Seibl, Simon, "Tablas de datos espectrales para la determinación de la estructura de compuestos orgánicos", 2ed., 1989, Springer-Verlag
- Predicción IR simple.
- Estimación simple de pKa.
- Estimación del coeficiente de partición octanol-agua.
- Análisis de reacción: estimación de cambio de entalpía en fase gaseosa, comparación de 1H NMR y 13C NMR.
- Versión de Windows 95/98 / NT (advertencia: ¡desactualizado!)
- Integración con OpenBabel, lo que permite a XDrawChem leer y escribir más de 20 formatos de archivos químicos diferentes.
Requisitos del sistema XDrawChem:
- UNIX y X Windows (Linux, SGI IRIX, Sun Solaris, otros ...) o Mac OS X
- Compilador ANSI C ++ (uso g ++)
- Qt 3.0 o posterior
- OpenBabel 1.100.2 o posterior
- Se recomienda encarecidamente el acceso a Internet, ya que varias características (InChI y salida SMILES canónica, búsquedas en bases de datos) dependen de recursos basados en el servidor.
